Hydroliza kwasowa białek jest zabiegiem drastycznym. Dlatego są także czynione próby zastosowania hydrolizy enzymatycznej. Uwolnienie aminokwasów podczas hydrolizy kwasowej jest z pewnością odmienne od uwalniania aminokwasów podczas hydrolizy enzymatycznej, zachodzącej w trakcie trawienia białka w przewodzie pokarmowym. W warunkach trawienia enzymatycznego kompletnie uwalniane aminokwasy można określić jako aminokwasy przyswajalne w odróżnieniu od uwalnianych po hydrolizie kwasowej aminokwasów ogólnych. Do badań nad przyswajalnością aminokwasów stosuje się zarówno pojedyncze enzymy, jak i układy enzymatyczne.
Niepełna hydroliza enzymatyczna białka za pomocą wybiórczych enzymów, np. pepsyny, papainy, trypsyny, pozwala jedynie określić różnice w uwalnianiu poszczególnych aminokwasów w badanych białkach, zależnie zarówno od budowy danego białka, jak i od ewentualnych zmian, które zaszły w białku pod wpływem obróbki technologicznej.
Ford i Salter (1966) zastosowali metodę trawienia enzymatycznego do charakteryzowania składu aminokwasowego białka poddanego zróżnicowanej obróbce termicznej. Mauron (1968) zaproponował kilka wskaźników obliczonych na podstawie zawartości aminokwasów w hydrolizatach enzymatycznych badanych białek. Camus i wsp. (1972, 1973), jak również Sautier (1974) stosowali trawienie enzymatyczne, w celu scharakteryzowania wartości odżywczej różnych białek.
Przegląd metod enzymatycznych stosowanych w ocenie wartości białek podaje Stakmann i Woldegiorgis (1975).
Na podstawie ilości uwolnionych aminokwasów podczas częściowej hydrolizy enzymatycznej nie można ocenić całkowitego poziomu aminokwasów przyswajalnych, ponieważ wiele 2 nich może występować w peptydach niestrawnych in vitro, natomiast rozkładanych in vivo. Stąd są przeprowadzane badania nad dopracowaniem warunków kompletnej hydrolizy enzymatycznej białka.
Hill i wsp. (1962) oraz Margoliash i wsp. (1962) określili całkowity skład aminokwasów kazeiny i cytochromu c stosując do trawienia następujący układ enzymatyczny: papaina, aminopeptydaza leucynowa, prolidaza.
Pieniążek i wsp. (Pieniążek i wsp. 1975, Kunachowicz i wsp. 1976) zastosowały trawienie enzymatyczne układem pankreatyna, prolidaza, aminopeptydaza leucynowa do oznaczania zawartości aminokwasów przyswajalnych w kazeinie i kazeinie ogrzewanej w doświadczeniach modelowych. Uzyskano zróżnicowanie uwolnionych aminokwasów największe (63,5% uwolnionego azotu aminokwasów) dla kazeiny natywnej, niższe (51,6%) dla kazeiny ogrzewanej i najniższe (36,1%) dla kazeiny ogrzewanej w obecności cukru. Otrzymano zatem ciekawe wyniki porównawcze, niemniej jednak ok. 40% azotu aminowego pozostawało w kazeinie natywnej nadal w peptydach, a więc hydroliza nie była kompletna.
Wydaje się, że opracowanie warunków kompletnej hydrolizy enzymatycznej różnych białek mogłoby wnieść istotny postęp w badaniach nad przyswajalnością aminokwasów.